На песчаных мелководьях, и у россыпей каменных глыб заказника многочисленны бычки, в толще воды атерина, хамса, стаи кефалей, все чаще можно встретить осетровых рыб. Здесь существуют хорошие условия для возобновления промысловых и аборигенных видов рыб, отдельных стадий их биологического цикла. Ихтиофауна природного заказника к настоящему времени насчитывает 62 вида и подвида рыб, что составляет более половины всего списка рыб Азовского моря, и включает все обитающие в Азово-Черноморском бассейне экологические группы рыб – морских, солоноватоводных понто-каспийских реликтовых, проходных и пресноводных. 7 видов из этого списка, включены в Красную книгу Республики Крым, белуга Huso huso (Linnaeus, 1758) так же в Красную книгу Российской Федерации (и др. охранные списки).