В средней части рва, расположенного в центре срединного плато горы Опук, находится карстовая полость, достигшая рекордной для Керченского полуострова и равнинного Крыма глубины — 33 метра. Верхняя часть полости пещеры Юбилейной представлена участком сейсмо-карстового рва с рухнувшими известняковыми глыбами. В южной стене начинается крутой (до 60˚), уходящий на глубину 15 метров ход. Нижняя стена хода сложена обвальным материалом, верхняя представлена коренными мшанковыми известняками, рассеченными вертикальной трещиной, по которой и заложена шахта.

Восточный край вершинного плато горы Опук на высоте 165−170 н.у.м. занимает крепостное сооружение Цитадель. Памятник фортификации Боспора, оно относится к позднеклассическому, эллинистическому и позднеантичному периоду и включает: куртины (крепостной вал), башню бастионного типа, внутреннюю застройку с казармами, зольник и оборонительную стену по водоразделу восточного склона горы.

Между горой Опук и деревней Яковенково, вдоль Чебакской балки и крайних восточных границ заповедника обнаружены наиболее ранние античные поселения. Как правило, неукрепленные, они состоят из отдельных сгруппированных хозяйств.

Найденные фрагменты амфорной тары VI—V вв. до н.э. позволяют предполагать, что освоение приморской части региона происходило одновременно с основанием Киммерика. К началу V в. до н.э. относится освоение горы Опук, ее прибрежной части до Кызаульского маяка и более дальних окрестностей ― долин Киркояшского и Кояшского озер, г. Приозерная. А все остальные выявленные сельские поселения в окрестностях Опука появляются в конце V в. до н.э. и в начале IV в. до н.э.

В кoтлoвинoпoдобной дoлине южнoгo склoна гoры Опук находится раннесредневековый памятник ― одно из крупнейших поселений салтово-маяцкой культуры на Керченском полуострове.

В слоях I в. до н.э. ― I в. н.э. заметно возрастает доля дичи (зайцы и птица), а также виноградных улиток, использовавшихся в качестве источника пищевого белка. Это, возможно, говорит о каких-то экономических трудностях населения и сложной политической ситуация на Боспоре. В период с конца II—III вв. н.э. до IV—VI вв. Киммерик стал пограничной крепостью, а его окрестности ― местом расселения федератов из числа варваров. В это время здесь заметно вырастает поголовье лошадей, мелкого рогатого скота и собак.

В последующее время, вплоть до времени возникновения у подножия горы Опук татарских деревень, жизнь на урочище почти прекращается. Однако не исключено наличие мелких, преимущественно скотоводческих хозяйств IX—XII вв. на его западном склоне, на месте городища Киммерик.

В котловине бухты Восточная обнаружены следы сельской усадьбы IX ― первой половины X вв. Площадь памятника составляет 0,5 га и включает жилые и хозяйственные постройки и колодец. Особый интерес представляет древняя дорога с подпорной стеной, сложенной из известняка.

В 2 км на юго-запад от горы Опук в Черном море находятся одиночные скалы, безусловно, опасные для современного и древнего мореходства. В их акватории в середине 1970-х аквалангисты из группы ялтинца Ю. Данилевского обнаружили «кладбище якорей»: античные каменные и свинцовые, средневековые железные и современные. Отдельные фрагменты древних якорей были подняты с морского дна и затем демонстрировались в Ялте.


В 1981 году аквалангисты ленинградского клуба «Поиск» вместе с военными гидрографами в 350 метрах к югу от скал обнаружили обломки амфор, конгломератную форму железного якоря и свинцовый шток деревянного античного якоря весом около 30 кг с коробчатой рамой посередине. Последний был вывезен в Ленинград и демонстрировался в музее клуба.