1. Античное гoрoдище Киммерик (VI в. дo н.э. — IV в. н.э.)
Руины античного города Киммерик, который возник на южном берегу Керченского полуострова на рубеже VI—V вв. до н. э и просуществовал до начала IV века н.э.
2. Цитадель (IV в. н.э.)
Памятник фортификации Боспора, оно относящийся к позднеклассическому, эллинистическому и позднеантичному периоду.
3. Холм А
Археологические материалы свидетельствуют об освоении горы Опук в эпоху поздней бронзы. На поселениях собраны фрагменты лепной посуды, изделия из кремня, культовые предметы, кости домашних и диких животных.
4. Античные и раннесредневековые поселения
Следы неукрепленных древних поселков можно найти также в приморской и более отдаленных частях региона.
5. Пoселение окрестностей Чебакскoй балки (V в. дo н.э. — IV—III вв. дo н.э.)
Между горой Опук и деревней Яковенково, вдоль Чебакской балки и крайних восточных границ заповедника обнаружены наиболее ранние античные поселения.
6. Поселение над источником (VII-IX вв. н.э.)
Раннесредневековый памятник ― одно из крупнейших поселений салтово-маяцкой культуры на Керченском полуострове.
7. Усадьба в бухте Восточная (VII-IX вв. н.э.)
Сельская усадьба IX ― первой половины X вв.: жилые и хозяйственные постройки и колодец.
8. Средневековая якорная стоянка у островов Элькен-Кая (VIII-XIII вв.)
На «кладбище якорей» обнаружены античные каменные и свинцовые, средневековые железные и современные.
9. Памятник военным топографам
Памятник военным топографам, погибшим на на острове Элькен-Кая (Скалы-Корабли) в годы Великой Отечественной войны.
10. Катакомбный комплекс и каменоломни
На востоке вершинного плато горы Опук расположены старые каменоломни. Каменоломни давно стали местом обитания множества летучих мышей.
11. Источник Кырк-Чокрак
В галерее каптированного источника можно осмотреть внутреннее устройство древнего водозаборника. Вода вытекает из 30-метрового тоннеля и попадает в бассейн, выложенный плитами известняка.